仁济医院建于1844年,是上海开埠后的第一家西医医院。 1932年扩建为一所设备较好、6层建筑的现代医院,并正式命名为“仁济医院”。 1946年结束了外国人管理医院的历史。 1952年,经华东军政委员会卫生部批准,为上海第二医学院附属仁济医院。 1966年,改名为工农兵医院。 1972年,改名为上海第二医学院附属第三人民医院。 1984年,恢复上海第二医学院附属仁济医院的名称。 1985年,更名为上海第二医科大学附属仁济医院。 1999年,仁济东院正式开业。 2005年,改名为上海交通大学医学院附属仁济医院。 2009年,仁济南院在闵行浦江镇奠基。 2011年,仁济西院启动整体修缮工程。 2012年,仁济南院正式开业。 2013年,生殖医学专科正式落户仁济北院。
   
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