2010年我院获批上海市第一批住院医师规范化培训基地；2014年成为国家第一批住院医师规范化培训基地。目前有国家级住院医师规范化培训专业基地神经内科、泌尿外科、神经外科、放射科、全科等19个基地；国家级住院医师规范化培训重点专业基地目前有妇产科、麻醉科、内科、外科。

2013年获批上海市第一批专科医师规范化培训专业基地；2017年成为国家级专科医师规范化培训制度试点基地。上海市专科医师规范化培训专业基地包括消化内科、肾脏内科、泌尿外科、妇产科、放射科等22个基地；国家级专科医师规范化培训制度试点基地目前有心血管病学、内科老年医学、内科危重症医学、普通外科学、外科危重症医学、神经外科学。