仁济医院药学部是一个集药品供应、药事管理、临床药学服务、教学、科研为一体的综合性药学部门，下设门急诊药房、住院药房、干保药房、药库、静脉药物配制中心、临床药学中心、上海交通大学海洋药物融合创新中心等部门，形成仁济东院引领、西院、南院、北院支撑的发展格局；现有药学专业技术人员186人，其中主任药师/研究员4人，副主任药师/副研究员11人；博士生导师3人，硕士生导师2人；具有博士学位13人，硕士学位26人，本科以上学历人员占有率为80%以上，形成了老中青结合、高中初级职称合理搭配的人才梯队。药学部在保障药品供应和质量的基础上，坚持以“合理用药”为核心，以“增强临床能力、创新研究体系”为抓手，重点打造“以循证药学为内核、特色临床为依托”的药物治疗管理创新体系，实现学科建设的跨越式发展，获教育部科技进步一等奖（2022），自然资源部科技进步一等奖（2023），两度获得海洋科学技术一等奖（2018、2022），并获中国医院管理奖金奖（2022），二星级全国青年文明号（2023），助力党支部入选全国公立医院临床科室标杆党支部（2023）、上海市公立医院党建工作样板支部（2022）。

药学部以智慧药学技术推进医院药品信息化和调剂自动化管理，不断优化药品管理与使用流程，提升药师服务质量和效率。已建立完善的网络管理系统，承担医院药品的遴选、采购、验收、贮存、养护、配送以及信息维护、数据上传、药事管理等工作，实现药品的全程化电子追踪；配备全自动发药机、单剂量分包系统、气道物流传输系统、麻精毒药品智能管理系统、冷链监控系统、温湿度监控系统、无人值守取药机等，加强智能化管理，确保药品调剂的准确性；不断优化前置审方系统，利用信息化手段实施前置处方审核和实时拦截，并设立独立的药物咨询室，提供用药指导，保障患者的用药安全；加强病区药学服务，严格精麻药品及抢救车与备用药品管理、加强手术室药房建设；配备有水平层流台、生物安全柜及静脉用药调配机器人，进行包括危害药品、肠外营养药物和其它静脉用药在内的集中调配，保证药品安全得同时做好医护人员防护。药学部目前已顺利通过“RTAC国际认证（药学部分）”复审。2023年承担了约480万张门、急诊处方调配，及22万住院患者的药品供应调剂及制备。

药学部坚守临床合理用药前沿阵地，创建了以临床药学为主体的重大慢病药物治疗管理创新体系，搭建了基于循证用药评价体系的合理用药决策系统，构建了以“精准检测-精细分型-靶向干预”为策略的精准用药体系，形成了抗感染、抗凝、抗肿瘤、内分泌、免疫、妇科、外科、临床药理等八大亚专业齐头并进的发展态势。。积极参与MDT多学科诊疗，开展危重症、疑难患者的药物监护，同时依托药学门诊、社区服务、互联网药学服务等，扩大药学服务范围。开创了“研究型临床药师培养模式”（获2021年度中国医院管理奖学科管理组银奖），激励优秀人才脱颖而出：焦伟华荣获国家优青（2020）、杨帆荣获科技部青年科学家（2022），同时还有13人次临床药师获得上海市青年拔尖、上海市科技启明星、浦江人才、扬帆计划等市级人才项目。林厚文主任荣获第十七届上海市科技精英（2022）、全国十大医学促进专家（2023）等。药学部牵头建立国内首个市级“上海抗凝药师联盟”及首个跨区域“长三角抗凝药师联盟”，有力推动区域同质化药物治疗管理模式。

药学部为首批国家临床药师培训基地、卫健委紧缺人才（临床药师）培训基地、中华医学会临床药师培训基地及上海市临床药师培训基地，已培养出全国各省市优秀临床药师200余名。同时作为上海交通大学、上海中医药大学、上海健康医学院等院校毕业实习基地、交大医学院临床药学院院长所在单位，长期致力于搭建优质临床药学教学平台，促进长三角临床药学教学资源共享。此外，药学部针对肿瘤、感染、炎症等重大疾病，聚焦海洋共生生物药源分子的结构与功能，建有海洋药源分子的发现与结构修饰、全合成与生物合成、微生物筛选与发酵、药理活性筛选与靶标-机制等药物创新研究平台，全面提升新药源分子的发现效率并拓宽其来源途径，推动海洋创新药物研发与转化。

药学部临床药物治疗管理及创新药物研究科技成果显著，近十年共获国家级课题50项（含44项国自然），牵头国家重点研发计划项目3项、国家科技重大专项1项，总经费超8000万；在国际期刊发表SCI论文226篇，授权国家发明专利25项（含2项国际PCT专利,1项美国专利）；研发了3个具有自主知识产权的候选新药，《丁烯酸内酯类化合物的制备方法和用途》项目实现科研转让1000万元。学科竞争力蝉联上海市公立医院药剂系列第一名！