上海交通大学医学院附属仁济医院以一体化管理、同质化运行为目标，推进医疗技术与服务同质化，输出仁济品牌，在符合当地标准规范的基础上，做好疑难疾病诊疗技术和新技术指导，建立统一的诊疗规范、质量标准，创新以人为本的服务模式、服务流程。搭建各合作医院与总院互联互通的信息系统和数据平台，发挥信息化关键纽带作用，提升医疗效率，辅助资源分配。推进人员的集约化管理和培养孵化，强化资源整合，建立完善资源共享、流通互惠机制，构建“管理、责任、文化、服务”共同体。

目前仁济医院共有9家紧密型医联体，4家市内医联体：嘉定区中心医院（仁济嘉定分院）、宝山区大场医院（仁济宝山分院）、浦东新区浦南医院（仁济浦南分院）、闵行区浦江医院（仁济浦江分院）。5家外省市医联体：宁波杭州湾医院（仁济医院宁波医院）、南通市第一人民医院（仁济医院南通医院）、SK无锡医院（仁济医院无锡医院）、国家消化系统疾病区域医疗中心（仁济医院安徽医院）、崖州湾科技城综合医院（仁济医院海南医院）。